文献データベース検索APIお試し

 今回から、生物学文献に付随する情報を使って、文献間の相関性を計算することができるかどうか調べ始めました。
 まずはその生物学文献に関わる、生物学論文の情報を引っ張って来れるように、PubMedなどの文献データベースから情報をとれるAPIなどについて調べてみました。
 するとどうやら、そういった文献データベース間の検索APIはもちろん用意されていて、URLからクエリを飛ばせば簡単に一覧が手に入るようです。

http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?

 とりあえずこのURLに、Rubyからopen-uriを使ってクエリを飛ばしてみましたが、問題なくxmlが返却されてきました。ここまでに、「PubMed APIのまとめ」を参考にさせていただきました。次回ももう少し仕組みを理解できるように、いろいろ試してみようと思います。